Το Μουσείο είναι αφιερωμένο στους αγώνες για την απελευθέρωση και ενσωμάτωση της Μακεδονίας στην ελληνική επικράτεια.
Ο κ. Πετσάλνικος, κατά τον χαιρετισμό του τόνισε ότι: « Οι ψηφιακές εφαρμογές, οι ανανεωμένοι οδηγοί, το οπτικοακουστικό σύστημα αυτο-ξενάγησης, η επανέκθεση πολύτιμων κειμηλίων, αλλά και η έμφαση που δίνεται στα πρωτότυπα εκπαιδευτικά προγράμματα, καθιστούν το Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα ένα μουσείο που αφουγκράζεται το παρόν και κοιτάζει προς το μέλλον».